Hola Amigo gracias por compartir otro proyecto en C++ relacionado al manejo de texto en este lenguaje, en esta ocasión tengo varias sugerencias para ti para mejorar un poco la experiencia de uso.

Tal vez sea mucho mejor evaluar la carpeta del proyecto y listar los archivos .txt que estén presentes y pedirle al usuario que los selecciones simplemente escribiendo un número que le hayas asignado a cada archivo así se evitará tener que escribir el nombre de los archivos que vas a comparar.

Como recomendación extra puedo decirte que hagas un solo video fusionado y editado con algunos títulos y transiciones, si haces esto puedes utilizar la etiqueta #steemvideo.