Saludos. Creo que mientras esos escritorios virtuales funciones dentro del mismo sistema operativo no será posible, aunque la verdad es que no estoy seguro, pues nunca lo he intentado.

El sistema Windows está diseñado para controlar un solo cursor, y aunque coloques dos mouses estos moverán al mismo cursor; sin embargo, tal vez con algún tipo de software especial para eso que deseas, puede que sea posible.